Все пути к файлам в редакторе хранятся в index.bin
Проблема в том, что при работе через карту новый, изменённый индекс.бин с вашими путями обнуляется и после перезагрузки карты все пути пропадают.
При работе через блокнот пути вообще никогда не появятся, так как в индекс.бин информацию умеет вносить только сам редактор. В таком случае пути к файлам, созданным/скопированным вручную, нужно прописывать с клавиатуры в соответствующие поля, а выбрать из дерева каталогов в редакторе вы их не сможете